বাংলাদেশের স্বাস্থ্য মন্ত্রণালয়ের মূল কাজগুলো দেশের স্বাস্থ্য পরিষেবার উন্নয়ন এবং সুরক্ষার উপর নির্ভর করে। মন্ত্রণালয়টি দেশব্যাপী স্বাস্থ্য সেবা পরিষেবা সম্পর্কিত নীতি, পরিকল্পনা এবং পরিচালনা করে থাকে। এরা স্বাস্থ্য সম্পর্কিত আইন, নীতি এবং পরিকল্পনা তৈরি করে, যাতে সকল বাংলাদেশি নাগরিক মৌলিক স্বাস্থ্য সেবা পেতে পারে।
মন্ত্রণালয়টি দেশের স্বাস্থ্য ব্যবস্থা বিকাশের জন্য সম্পূর্ণ পরিকল্পনা তৈরি করে এবং তা পরিচালনা করে থাকে। এটি স্বাস্থ্য সেবা সম্পর্কিত প্রচারপত্র, শিক্ষাপ্রসারণ, স্বাস্থ্য সম্পর্কিত গবেষণা এবং প্রযুক্তি পরিষেবার উন্নয়নে ভূমিকা পালন করে। মন্ত্রণালয় স্বাস্থ্য সেবার মান উন্নয়ন এবং উন্নত করার জন্য বিভিন্ন পরিকল্পনা এবং প্রচারাভিযান চালায়। এছাড়াও, এটি দেশের স্বাস্থ্য প্রতিরক্ষা ব্যবস্থা প্রস্তুত রাখে এবং মহামারী, স্বাস্থ্য সংক্রামক রোগ এবং অন্যান্য স্বাস্থ্য সম্পর্কিত উত্থানের কার্যক্রমে সক্রিয়ভাবে অংশগ্রহণ করে।
স্বাস্থ্য মন্ত্রণালয়ের উদ্দেশ্য হলো স্বাস্থ্য সেবার সমান প্রবেশদ্বার নিশ্চিত করা, এবং দেশের স্বাস্থ্য অবস্থার উন্নয়ন। মন্ত্রণালয়টি স্বাস্থ্য সম্পর্কিত অডিট এবং পর্যবেক্ষণ পরিচালনা করে, যাতে সেবাগুলো উচ্চমানের হয় এবং সকল নাগরিকের প্রতি দরিদ্রভাবে প্রদান করা হয়। এছাড়াও, মন্ত্রণালয়টি অন্তর্জাতিক সংস্থাগুলোর সাথে সহযোগিতা স্থাপন করে এবং বিশ্বাস্তর দেশগুলোর সাথে শিক্ষা ও প্রযুক্তি বিনিময়ের প্রক্রিয়া চালায় যাতে দেশের স্বাস্থ্য পরিষেবা আন্তর্জাতিক মানদণ্ডের সাথে সম্পর্কিত থাকে।
বাংলাদেশের স্বাস্থ্য মন্ত্রণালয়ের অনেক সফলতা রয়েছে, যেমন মাতৃমৃত্যু হার কমানো, শিশু মৃত্যু হার কমানো, মহামারী প্রতিরোধ ব্যবস্থা উন্নত করা এবং স্বাস্থ্য সেবা সম্পর্কিত অনেক প্রকল্প সফলভাবে সম্পন্ন করা। এছাড়াও, এটি স্বাস্থ্য সেবার প্রবেশদ্বার বাড়ানোর জন্য স্বাস্থ্য কেন্দ্র, হাসপাতাল এবং ক্লিনিক স্থাপন ও উন্নয়নের উদ্যোগ নেয়। এই সকল প্রচেষ্টা বাংলাদেশের স্বাস্থ্য অবস্থাকে উন্নত করতে সাহায্য করেছে।